第二章 廣說正行行願
廣說正行行願分二：正行願與總結願。
【第一節】 正行願
正行願分十六個願：1.意樂清淨願；2.不忘覺心願；3.不染妙行願；4.利樂眾生願；5.盔甲精進願；6.不離道友願；7.依善知識願；8.現前供佛願；9.秉持正法願；10.獲功德藏願；11.趣入行境願；12.十力願；13.對治願；14.事業願；15.隨學願；16.依總結顯示迴向願。
一、意樂清淨願
佛經裡講過，若要成就任何善願，必須先累積資糧、淨除業障，這是最根本的；此外還有一個方法：受持清淨戒，如此所發的願皆可成就。前面已講過成就願的因，現在講正行發願的第一個願：意樂清淨願。「意樂」不是指快樂，而是心的意思，通常被翻譯為「意樂」或「意」。這裡的心清淨願又分四：供養願、圓滿密意願、淨化佛剎願、利益眾生願。
1.供養願
我隨一切如來學，修習普賢圓滿行，
供養過去諸如來，及與現在十方佛。
我願生生世世具足願菩提心與行菩提心，並跟隨十方三世一切如來修習、圓滿普賢六度萬行。並將頂禮等七支供的善根，以及自己的身體、受用、三世所累積的一切善根，供養過去一切如來與現在十方三世諸佛。
按照藏文《普賢行願品》的版本：「我隨一切如來學，修習普賢圓滿行。」二句是放在「無垢無破無穿漏」句子的前面，但也不必按照藏文的順序調動，也許此部經在印度有不同的梵文版本，何況過去的譯師都具有相當高的智慧，幾乎都是佛菩薩的化身，所以不需調動，瞭解內容就好。
「供養過去諸如來，及與現在十方佛。」即是供養願，供養什麼呢？就是以前面講的頂禮、供養、隨喜、懺悔、請法等七支供為主，再加上自己的一切善業。最殊勝的供養就是以修行做為供養，如每天念誦一遍《普賢行願品》也是殊勝的供養，沒有比聞思修更殊勝的供養；此外，自己的身體、受用、三世所累積的善根也一併供養。供養的對境是什麼？是過去以及現在十方諸佛，也就是我供養過去、現在諸佛，將來也能夠供養未來諸佛。所有供品恆時獻予過去佛與為了一切眾生而安住的現在佛，在他們面前幻變出無數無量的普賢雲供，令諸佛菩薩歡喜，使自己與所有眾生的福慧資糧皆能圓滿。
2.圓滿密意願
未來一切天人師，一切意樂皆圓滿，
我願普隨三世學，速得成就大菩提。
我願普隨三世學，速得成就大菩提。
為了度化無邊無際的眾生，未來一切的人天導師，任運具足成佛的種種因緣後，圓滿意樂而逐漸成佛；我也願能隨著三世一切佛學習，速疾獲得殊勝、廣大的菩提。
「圓滿」是滿願的意思，「密意」是指佛的意趣、想法、意願。圓滿什麼呢？就是希望這些未來佛的密意能夠速疾圓滿。「未來一切天人師」就是未來一切諸佛，包括過去已在密嚴剎土成佛，但尚未在人間示現的諸佛，以及安住第十地最後有的菩薩。為何佛是天人師呢？如經云：「善男子，諸佛雖為一切眾生無上大師，然經中說為天人師，何以故？善男子，諸眾生中，唯天與人能發阿耨多羅三藐三菩提心，能修十善業道，能得須陀洹果、斯陀含果、阿那含果、阿羅漢果、辟支佛果、阿耨多羅三藐三菩提果等，故號佛為天人師。」這裡的未來佛也可解釋為一切眾生，因為眾生都是未來佛，尤其是已經進入小乘、大乘、金剛乘的眾生。「一切意樂皆圓滿」即希望過去已成佛但尚未示現的諸佛，能因緣成熟，化現於娑婆世界度化眾生，而安住在第十地最後有的菩薩，也能速疾圓滿福慧資糧而成佛，還有已經進入乃至將來才有機緣進入三乘道、福慧資糧尚未圓滿的眾生，因我供養諸佛菩薩的功德利益及願力，不用很費力就能迅速圓滿福慧資糧，然後在菩提金剛座成佛，度化無邊無際的眾生。「我願普隨三世學，速得成就大菩提。」我也發願跟隨過去、現在、未來一切諸佛學習，願能迅速證得正等正覺大菩提。
3.淨化佛剎願
所有十方一切剎，廣大清淨妙莊嚴，
眾會圍繞諸如來，悉在菩提樹王下。
願十方一切不淨的世間剎土，轉變為遠離一切過患且美妙莊嚴的清淨剎土；淨土中央的菩提樹下坐有莊嚴、崇高如須彌山的如來，菩薩等眾眷屬皆在一旁恭敬圍繞，諦聽如來宣說正法甘露。
淨化不是把本來不清淨的變為清淨，而是透過修練、逐漸覺悟一切剎土的本質皆是清淨的。如何練習呢？要知道眾生的本質與佛一樣是清淨的，世間一切也同樣本是清淨的，但需要依靠觀修來發現其清淨的本質。金剛乘中所提到的淨觀是在聽法或修法時，把自己所處的環境觀想為極樂世界等清淨的剎土，其實本來就清淨，但因為眾生的業力而無法顯現，於是透過淨觀等修行方法而逐漸發覺。此處主要講的是發願，因為我們這世間幾乎天天都有火災、水災等各種天災和人為的禍亂，還有很多快樂與不快樂、好與不好的分別等等，故發願「所有十方一切剎，廣大清淨妙莊嚴。」即在十方一切不淨的外器世間[1]中，將自己的身體、一切受用與善根等，全部為了眾生而發願迴向，願以此功德力，將此不淨的外器世間轉化為廣大、美妙、莊嚴的清淨剎土，如同《彌陀經》所述的極樂世界，發願所有不淨的世界都能如此轉化，這就是器世間的淨化。「眾會圍繞諸如來，悉在菩提樹王下。」是內情眾生的淨化，「眾會」是指菩薩等眾眷屬，他們圍繞著一切諸佛，地點在哪裡呢？就在菩提樹王下，也就是千佛成佛的金剛座[2]。可以想像這美妙的畫面：所有外器世間變成廣大、莊嚴的極樂世界，六道眾生都變成菩薩眷屬圍繞著如來，並在菩提樹王下聽聞佛法。此處的藏文版強調菩提樹王下除了如來之外，沒有一處空間不被菩薩聖眾遍布、充滿著，並在佛前專注地聆聽無上的妙法。
